O MICRODia junta 11 instituições pertencentes à PPBI, com as suas respetivas Unidades de Microscopia ótica avançada.
As Instituições que se juntaram à iniciativa são:
- Universidade do Algarve (CBMR)
- Instituto Gulbenkian de Ciência (IGC)
- Instituto de Tecnologia Química e Biológica (ITQB)
- Instituto Superior Técnico (IST)
- Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa (FCUL)
- CEDOC – Chronic Diseases
- Centro de Neurociências e Biologia Celular (CNC)
- Universidade de Aveiro (iBiMED)
- Universidade da Beira Interior (CICS-UBI)
- Instituto de Inovação Investigação em Saúde (I3S – IBMC e I3S – INEB)
